Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc37F8VPK0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc37F8VPK0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc37F8VPK0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc37F8VPK0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc37F8VPK0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms