Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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