Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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