Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms