Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms