Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkhd1E9PZ36 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms