Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3002E9PW72 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms