Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh8D3Z6W3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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