Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms