Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf217D3YYI7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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