Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc170D3YXL0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms