Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms