Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms