Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms