Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf518bB2RRE4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf518bB2RRE4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms