Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms