Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf3B2RQG2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms