Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms