Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms