Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms