Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FocadA2AKG8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms