Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Camsap1A2AHC3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Camsap1A2AHC3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms