Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms