Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprfA2A8L5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprfA2A8L5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprfA2A8L5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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