Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nlrp1bA1Z198 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nlrp1bA1Z198 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nlrp1bA1Z198 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nlrp1bA1Z198 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nlrp1bA1Z198 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrp1bA1Z198 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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