Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms