Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms