Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt16Q9Z2K1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms