Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms