Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms