Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp2Q9Z0E6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms