Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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