Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorbs3Q9R1Z8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms