Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms