Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms