Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms