Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms