Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms