Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ripk3Q9QZL0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms