Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms