Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

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Length 1,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Capn15Q9JLG8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms