Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms