Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms