Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms