Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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