Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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