Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms