Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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