Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms