Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms